C'est un truc que je fais pour certains lines et j'ai deux façons de faire :
1 - mettre le calque avec le line (sur fond blanc) en mode produit et en redéfinir la couleur (CTRL + U, cocher "redéfinir", augmenter la luminosité et la saturation, modifier la teinte si besoin.)
Avantage : facile
Inconvénient : le mode produit ne "masque" pas ce qu'il y a dessous, donc pas toujours adapté.
De plus le line est de couleur uniforme.
2 - extraire le line (sélectionner une des couches, inverser la sélection, la remplir en noir ou en une autre couleur sur un calque vide), locker les pixels transparents, le mettre en mode mode ce-que-tu-veux puis peindre dans la couleur choisie.
Avantage : permet d'adapter les couleurs selon les zones, de choisir le mode de fusion.
Inconvénient : je ne fais ça que sur toshop, je ne sais pas si les autres logiciels permettent de travailler sur les couches, ni comment.
Voilà pour l'esprit des techniques, si tu veux plus de détails sur comment s'y prendre exactement, just ask
.